36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1512 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 335 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  69.11 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.2 
 
 		 648 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  38.78 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  34.41 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  32.16 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  23.19 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.19 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  24.27 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.12 
 
 		 524 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.39 
 
 		 341 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.49 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  23.67 
 
 		 618 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  22.94 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.2 
 
 		 540 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.67 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.63 
 
 		 797 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  22.47 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 		 636 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 		 545 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 535 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 495 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 1112 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  22.65 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 537 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>