48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2371 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  46.88 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.47 
 
 		 648 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  38.78 
 
 		 335 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  37.97 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.83 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.91 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.15 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.29 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.78 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.65 
 
 		 495 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  22.27 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.29 
 
 		 472 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 348 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 636 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  22.03 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.66 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.69 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  22.86 
 
 		 533 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.15 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.98 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.35 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  25.78 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.29 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.1 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  21.58 
 
 		 509 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 476 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  22.13 
 
 		 524 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.63 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.79 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 855 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.32 
 
 		 1186 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.67 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 472 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  21.94 
 
 		 580 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 471 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  22.28 
 
 		 618 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.43 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>