184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0191 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 512 aa  1065    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  45.91 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  36.83 
 
 		 519 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  37.45 
 
 		 532 aa  309  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.76 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.39 
 
 		 547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.39 
 
 		 546 aa  283  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.81 
 
 		 538 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  34.83 
 
 		 550 aa  280  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.95 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.52 
 
 		 539 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.01 
 
 		 577 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.52 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  35.06 
 
 		 512 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  36.92 
 
 		 497 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  33.2 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.88 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  31.76 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.17 
 
 		 558 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  33.77 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 581 aa  237  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  31.57 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  35.68 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.52 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.7 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  32.18 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.44 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  28.93 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.94 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.91 
 
 		 556 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  30.77 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.59 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  31.56 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  31.03 
 
 		 545 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 		 535 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  37.63 
 
 		 497 aa  203  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.27 
 
 		 540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 492 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.39 
 
 		 488 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  36.05 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.3 
 
 		 546 aa  183  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 571 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.34 
 
 		 746 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  31.99 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 		 586 aa  181  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  29.01 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  31.11 
 
 		 591 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 572 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.29 
 
 		 536 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 		 560 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.42 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.06 
 
 		 650 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 551 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 		 518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.19 
 
 		 1474 aa  147  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 1195 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 522 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 665 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 525 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.26 
 
 		 365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.43 
 
 		 1585 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 691 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.49 
 
 		 527 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 532 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.85 
 
 		 797 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.3 
 
 		 1338 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  30.32 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  25.62 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.05 
 
 		 472 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.33 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  40.77 
 
 		 343 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 537 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  25.85 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.59 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.62 
 
 		 901 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.88 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>