177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2556 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 319 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  50.93 
 
 		 325 aa  301  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  47.3 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  46.79 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  36.95 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.92 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  31.8 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 		 384 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  33.08 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.47 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 644 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.96 
 
 		 522 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.38 
 
 		 501 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.79 
 
 		 509 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  29.85 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  32.64 
 
 		 533 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.85 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 495 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  30.13 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.8 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  28.11 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.6 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.67 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 		 855 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  25.28 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.92 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 		 699 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.87 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  25.95 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 498 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  27.47 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  27.15 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 		 545 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.27 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  24.05 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.01 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.09 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.33 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.32 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  27.99 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.87 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.31 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  27.71 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 497 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  26.03 
 
 		 535 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  28.92 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.25 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  26.07 
 
 		 546 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.62 
 
 		 640 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  25.79 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  27.05 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  23.61 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.82 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.17 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.62 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.51 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  23.28 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  24.49 
 
 		 712 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 675 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.98 
 
 		 536 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  21.74 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.53 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.22 
 
 		 522 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.6 
 
 		 562 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  26.51 
 
 		 1186 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.95 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 563 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.35 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  23.72 
 
 		 527 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 		 511 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>