151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2447 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  100 
 
 		 468 aa  950    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  70 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  48.12 
 
 		 315 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  48.12 
 
 		 315 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  37.89 
 
 		 527 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  47.59 
 
 		 311 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 		 311 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  43.49 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.62 
 
 		 524 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  43.85 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  43.67 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  42.68 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  43.06 
 
 		 618 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  42.3 
 
 		 317 aa  226  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  41.75 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.08 
 
 		 316 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.96 
 
 		 1186 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.9 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  38.39 
 
 		 535 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.58 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.74 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  38.32 
 
 		 679 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  42.46 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  34.29 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.52 
 
 		 385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.04 
 
 		 367 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  31.61 
 
 		 326 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.52 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.61 
 
 		 320 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.02 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.12 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.81 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  31.12 
 
 		 344 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  35.96 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 487 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  29.23 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.57 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.74 
 
 		 1338 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  33.7 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.27 
 
 		 712 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  31.48 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 330 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  30.34 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  41.94 
 
 		 1363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  43.97 
 
 		 772 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  42.55 
 
 		 781 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  29.75 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  30.46 
 
 		 667 aa  101  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 315 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  33.05 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  32.44 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.04 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.86 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  26.45 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.66 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  25.78 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  30.04 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.84 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.25 
 
 		 946 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  28.69 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.44 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.11 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  24.41 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.52 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 829 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.21 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 636 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.04 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.72 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.74 
 
 		 699 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.3 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 551 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 		 586 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.39 
 
 		 355 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.39 
 
 		 356 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  34.29 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 547 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>