35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0698 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  100 
 
 
369 aa  766    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  84.25 
 
 
381 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  47.93 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  38.16 
 
 
571 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  34.71 
 
 
501 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.62 
 
 
494 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  31.83 
 
 
1278 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  30.34 
 
 
345 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.95 
 
 
493 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  34.4 
 
 
1197 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  28.94 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  29.21 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  29.52 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  29.25 
 
 
422 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  26.45 
 
 
468 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.19 
 
 
509 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.84 
 
 
533 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 
487 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  24.81 
 
 
450 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  26.67 
 
 
535 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  26.62 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  24.03 
 
 
679 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  24.75 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  23.28 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
644 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.48 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  25.48 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.56 
 
 
1186 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  22.97 
 
 
855 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  23.4 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>