15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4425 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  61.03 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  28.89 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  28.94 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  30.8 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  27.07 
 
 		 1197 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.99 
 
 		 571 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  25.62 
 
 		 475 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  26.07 
 
 		 493 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.2 
 
 		 494 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  29.66 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1278 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  27.09 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.65 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>