32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  100 
 
 		 1197 aa  2347    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  41.06 
 
 		 571 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  35.87 
 
 		 475 aa  167  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  31.72 
 
 		 501 aa  157  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  33.53 
 
 		 325 aa  151  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  34.4 
 
 		 369 aa  143  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  31.03 
 
 		 381 aa  143  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.42 
 
 		 494 aa  132  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 493 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1278 aa  105  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  30.68 
 
 		 488 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  27.07 
 
 		 360 aa  95.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  30.4 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  29.35 
 
 		 345 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 1505 aa  60.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1756 aa  58.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  35.64 
 
 		 848 aa  56.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  45 
 
 		 639 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  31.37 
 
 		 653 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 551 aa  53.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  36.89 
 
 		 599 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.33 
 
 		 940 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  39.58 
 
 		 514 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  43.75 
 
 		 758 aa  49.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  31.07 
 
 		 1028 aa  48.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1657 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 1467 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.29 
 
 		 953 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.05 
 
 		 729 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  28.89 
 
 		 793 aa  44.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  45.9 
 
 		 2117 aa  44.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>