172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3224 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 444 aa  911    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  47.25 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.14 
 
 		 316 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  29.43 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.95 
 
 		 618 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  30.96 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  30.7 
 
 		 1186 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.38 
 
 		 320 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  28.42 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.22 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.28 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  29.94 
 
 		 679 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.04 
 
 		 344 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  30.49 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.82 
 
 		 464 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.96 
 
 		 385 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.62 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  38.64 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.89 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  28.95 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  35.19 
 
 		 326 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 		 315 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.33 
 
 		 367 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  36.02 
 
 		 317 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  35.91 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  35.53 
 
 		 311 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  35.08 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  32.69 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  34.59 
 
 		 317 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  35.31 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.86 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.54 
 
 		 1338 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.02 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  32.47 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.2 
 
 		 712 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  34.2 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  34.85 
 
 		 313 aa  130  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  30 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  32.9 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  33.66 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 644 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  26.27 
 
 		 667 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  28.1 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.35 
 
 		 315 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.5 
 
 		 855 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  29.72 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.2 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.54 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.07 
 
 		 829 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.97 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.23 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 1164 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.26 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  30.97 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  30.16 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.92 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.83 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.96 
 
 		 519 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 538 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.2 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.65 
 
 		 357 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  28.02 
 
 		 746 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  26.67 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  29.09 
 
 		 912 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.3 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.64 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  26.98 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.52 
 
 		 965 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 572 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  30.63 
 
 		 629 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  27.95 
 
 		 497 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.77 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.72 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.75 
 
 		 577 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.38 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>