48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1011 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 471 aa  978    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  78.98 
 
 		 471 aa  797    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  26.78 
 
 		 679 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  30.67 
 
 		 1186 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  26 
 
 		 535 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.64 
 
 		 533 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.25 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  22.66 
 
 		 618 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 326 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.68 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.45 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  24.31 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.46 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.53 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.99 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.38 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.78 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.7 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.8 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.32 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.44 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25.68 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.12 
 
 		 667 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  26.36 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  27.25 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  25.23 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  22.99 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  28.4 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  24.03 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.05 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 1338 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  25.6 
 
 		 313 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  23.08 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.86 
 
 		 330 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 319 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  22.38 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  31.86 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>