89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1323 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 330 aa  672    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.37 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  61.16 
 
 		 326 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  60.75 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  61.25 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  57.32 
 
 		 346 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  56.78 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.39 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  55.42 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  57.1 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  53.3 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.79 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.22 
 
 		 444 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  37.91 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  34.04 
 
 		 533 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.63 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  34.73 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  34.33 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  32.72 
 
 		 464 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 		 524 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  31.36 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.06 
 
 		 618 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.94 
 
 		 1186 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.15 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.95 
 
 		 535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  29.75 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  32.24 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.41 
 
 		 679 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  30.75 
 
 		 527 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  32.09 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  29.5 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.73 
 
 		 1338 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.34 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.54 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 644 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.43 
 
 		 401 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.1 
 
 		 712 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.16 
 
 		 667 aa  86.3  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.57 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30.61 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.9 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.06 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.73 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 495 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 472 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32 
 
 		 640 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  34.12 
 
 		 472 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.78 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 855 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.58 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.2 
 
 		 576 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 572 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  38.81 
 
 		 536 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.27 
 
 		 810 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  35.05 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.62 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  39.24 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 543 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  36.99 
 
 		 713 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  35.06 
 
 		 527 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 829 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  37.14 
 
 		 525 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 636 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 		 465 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  35.62 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.67 
 
 		 562 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>