120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1928 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  100 
 
 		 712 aa  1445    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  51.12 
 
 		 1338 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  43.99 
 
 		 667 aa  355  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  42.51 
 
 		 535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  39.71 
 
 		 679 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.54 
 
 		 1186 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  33.27 
 
 		 524 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 509 aa  224  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  33.47 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.92 
 
 		 618 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.75 
 
 		 464 aa  187  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  31.88 
 
 		 383 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.04 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  28.03 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 315 aa  144  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 315 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 315 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.2 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 		 311 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  30.75 
 
 		 311 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  31.82 
 
 		 317 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 383 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  30.88 
 
 		 317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  30.53 
 
 		 302 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  31.67 
 
 		 348 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.04 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 		 344 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.13 
 
 		 367 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  32.8 
 
 		 527 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.28 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 326 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.59 
 
 		 346 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 		 316 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 644 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.64 
 
 		 346 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.47 
 
 		 320 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  28.45 
 
 		 344 aa  101  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.91 
 
 		 330 aa  97.4  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 330 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  24.25 
 
 		 404 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 324 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 323 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  28.4 
 
 		 313 aa  88.2  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  26.5 
 
 		 344 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  31.82 
 
 		 901 aa  81.6  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.11 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.22 
 
 		 471 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.07 
 
 		 965 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  36.6 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  32.12 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  36.89 
 
 		 912 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  31.64 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  31.25 
 
 		 1164 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  31.85 
 
 		 928 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 536 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 348 aa  63.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  26.67 
 
 		 756 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.57 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 604 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  27.72 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  27.72 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  30.95 
 
 		 1122 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.29 
 
 		 393 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 1015 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  33.09 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  34.25 
 
 		 955 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.4 
 
 		 1037 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  22.33 
 
 		 536 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  21.77 
 
 		 780 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 306 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 560 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  29.56 
 
 		 629 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  27.88 
 
 		 471 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 334 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.41 
 
 		 338 aa  54.7  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.51 
 
 		 855 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.36 
 
 		 550 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  28.44 
 
 		 912 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.45 
 
 		 953 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  23.15 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 505 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 636 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.12 
 
 		 1146 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.93 
 
 		 746 aa  51.6  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.13 
 
 		 525 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 563 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 		 571 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.44 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>