121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1660 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  100 
 
 		 667 aa  1357    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  45.38 
 
 		 1338 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  42.93 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  36.29 
 
 		 535 aa  266  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  37.07 
 
 		 679 aa  249  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  35.82 
 
 		 1186 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.16 
 
 		 618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  29.1 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  29.34 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.12 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.6 
 
 		 383 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.59 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  33.05 
 
 		 311 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 315 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 315 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 444 aa  124  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 311 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.02 
 
 		 344 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  32.23 
 
 		 317 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  31.94 
 
 		 317 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.29 
 
 		 401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.54 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.66 
 
 		 383 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.06 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.21 
 
 		 367 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 644 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  28.33 
 
 		 302 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.08 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.18 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.15 
 
 		 346 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.44 
 
 		 324 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  28.95 
 
 		 326 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 330 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.94 
 
 		 335 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  27.81 
 
 		 344 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.59 
 
 		 487 aa  98.2  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.88 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 		 323 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  26.25 
 
 		 344 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25.08 
 
 		 527 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.66 
 
 		 320 aa  90.5  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.93 
 
 		 385 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.83 
 
 		 471 aa  88.6  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.33 
 
 		 313 aa  87.8  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  27.87 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  27.72 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  50.75 
 
 		 1937 aa  66.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  32.66 
 
 		 1015 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.97 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  30.06 
 
 		 1122 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  35.29 
 
 		 1172 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  32.11 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  34.11 
 
 		 928 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 563 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  31.75 
 
 		 472 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.58 
 
 		 965 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.69 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 376 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  22.15 
 
 		 315 aa  54.7  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.45 
 
 		 829 aa  54.7  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 		 951 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  27.82 
 
 		 479 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  28.93 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  23.96 
 
 		 527 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  28.12 
 
 		 912 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 348 aa  52.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  27.97 
 
 		 1164 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  45.31 
 
 		 2375 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.31 
 
 		 560 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  34.65 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  27.52 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  32.26 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 		 581 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.96 
 
 		 384 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.76 
 
 		 577 aa  50.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  22.44 
 
 		 522 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.34 
 
 		 746 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.33 
 
 		 923 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.67 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.37 
 
 		 576 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 310 aa  49.3  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.34 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  29.51 
 
 		 797 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  28.24 
 
 		 479 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.19 
 
 		 522 aa  48.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 536 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  26.56 
 
 		 470 aa  47.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26.16 
 
 		 338 aa  47.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.08 
 
 		 901 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>