190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0843 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 470 aa  952    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  65.87 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  66.44 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  64.38 
 
 		 479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  57.47 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  71.43 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  54.15 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.51 
 
 		 639 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.61 
 
 		 1007 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  45.73 
 
 		 999 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  47.06 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  41.39 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  68.42 
 
 		 566 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.68 
 
 		 815 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.75 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  36.13 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  36.98 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.59 
 
 		 289 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.62 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  34.8 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  49.23 
 
 		 951 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.74 
 
 		 883 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  46.97 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  34.6 
 
 		 283 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  43.03 
 
 		 1122 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.69 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.58 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  40.52 
 
 		 928 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.47 
 
 		 261 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.1 
 
 		 1290 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  42.97 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.38 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  42.97 
 
 		 965 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 642 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 641 aa  107  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  44.7 
 
 		 1015 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  29.9 
 
 		 281 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.78 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 384 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 1164 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  29.57 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  41.18 
 
 		 912 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  39.24 
 
 		 1290 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 629 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 		 1321 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.52 
 
 		 274 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30 
 
 		 1694 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 746 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.56 
 
 		 884 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.28 
 
 		 569 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  40.91 
 
 		 679 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.76 
 
 		 627 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.51 
 
 		 588 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 683 aa  94  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  39.37 
 
 		 535 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.99 
 
 		 819 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  35.44 
 
 		 780 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  35.44 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.94 
 
 		 1059 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  38.16 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.79 
 
 		 288 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 752 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.64 
 
 		 286 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  31.43 
 
 		 1028 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.77 
 
 		 742 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 301 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.15 
 
 		 912 aa  90.1  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  30.39 
 
 		 276 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  37.11 
 
 		 1186 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.48 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  29.74 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  31.68 
 
 		 1918 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 		 957 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  34.32 
 
 		 260 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.42 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  40.91 
 
 		 884 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  37.21 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  29.18 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.58 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.32 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 		 1332 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.23 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 837 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.58 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35.57 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.96 
 
 		 1441 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.95 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 877 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  36.18 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>