110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5224 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 566 aa  1126    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2627  hypothetical protein  42.05 
 
 		 396 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  39.27 
 
 		 396 aa  276  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.25 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  68.42 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  67.65 
 
 		 469 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  59.85 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.98 
 
 		 393 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  52.24 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.32 
 
 		 396 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  55.22 
 
 		 479 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.78 
 
 		 580 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  50.75 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  44.9 
 
 		 1015 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 1122 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  42.96 
 
 		 501 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  48.84 
 
 		 951 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  42.75 
 
 		 912 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  44.93 
 
 		 746 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  42.96 
 
 		 965 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  44.36 
 
 		 679 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  44.78 
 
 		 1164 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  43.7 
 
 		 928 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 629 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  38.46 
 
 		 536 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.54 
 
 		 1290 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  39.1 
 
 		 683 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  37.91 
 
 		 780 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  26.72 
 
 		 884 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  39.55 
 
 		 536 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.56 
 
 		 1186 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 535 aa  87  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 509 aa  87  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  29.79 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.35 
 
 		 837 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  28.22 
 
 		 791 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  39.85 
 
 		 863 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  38.28 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  39.1 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 541 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.82 
 
 		 957 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2956  hypothetical protein  26.09 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1167 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.11 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  41.44 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.15 
 
 		 982 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  38.69 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.75 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  39.09 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 1132 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.45 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32.81 
 
 		 1391 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  36.43 
 
 		 1444 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.35 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  39.64 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 802 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 845 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  32.39 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 870 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.18 
 
 		 777 aa  67  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.74 
 
 		 1356 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  30.38 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.67 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 840 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  36.17 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.64 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 1380 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 945 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  32.69 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  34.92 
 
 		 877 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  34.65 
 
 		 869 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  39.1 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.03 
 
 		 1295 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.17 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.81 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.64 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  29.85 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.07 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 918 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  45.68 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.94 
 
 		 1732 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.88 
 
 		 953 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 1505 aa  54.3  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.58 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.93 
 
 		 667 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.14 
 
 		 2554 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  27.5 
 
 		 1091 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.14 
 
 		 3295 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  31.69 
 
 		 948 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.56 
 
 		 801 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.43 
 
 		 1321 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.44 
 
 		 1338 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 		 797 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.8 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>