80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0823 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  52.23 
 
 		 315 aa  323  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  52.92 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  51.89 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  51.88 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  51.03 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  51.56 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  41.12 
 
 		 533 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  41.03 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 524 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  40.27 
 
 		 509 aa  228  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  39.87 
 
 		 618 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  37.42 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  40.53 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  41.81 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.31 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  34.9 
 
 		 527 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  34.33 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.75 
 
 		 1186 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  34.29 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.67 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.27 
 
 		 679 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.42 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.79 
 
 		 487 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  31.48 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.53 
 
 		 712 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.09 
 
 		 1338 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  31.25 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.88 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  31.16 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  30.92 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.52 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.7 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  29.97 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 644 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.71 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  28.23 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.74 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  27.27 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.9 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.61 
 
 		 346 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.33 
 
 		 667 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.62 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.85 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.07 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  30.39 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.57 
 
 		 346 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.56 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.68 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 357 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  22.74 
 
 		 522 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.39 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  29.2 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 		 586 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 665 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 506 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  22.93 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  23.4 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.4 
 
 		 505 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.31 
 
 		 512 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 		 804 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  22.31 
 
 		 519 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 547 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>