154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1077 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 464 aa  932    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  67.66 
 
 		 470 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  63.09 
 
 		 479 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  64.27 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  70.46 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  51.95 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  50.79 
 
 		 539 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.61 
 
 		 639 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.45 
 
 		 1007 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  48.97 
 
 		 999 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  48.35 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.91 
 
 		 815 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  39.45 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  59.85 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.02 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  32.51 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 361 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  36.97 
 
 		 289 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.95 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  35.16 
 
 		 279 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  35.01 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  35.97 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.41 
 
 		 633 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.54 
 
 		 1290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  29.12 
 
 		 883 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.84 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.73 
 
 		 281 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 641 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 642 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.28 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 1321 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.99 
 
 		 752 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.94 
 
 		 627 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.65 
 
 		 569 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.36 
 
 		 1059 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.52 
 
 		 261 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.64 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.22 
 
 		 288 aa  93.2  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 509 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  40.15 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.81 
 
 		 742 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  41.04 
 
 		 912 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.12 
 
 		 912 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.14 
 
 		 1028 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.36 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.07 
 
 		 819 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  39.85 
 
 		 629 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.41 
 
 		 1694 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  30.36 
 
 		 276 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  40.79 
 
 		 524 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.24 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  33.92 
 
 		 1015 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  38.06 
 
 		 1164 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 951 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  34.71 
 
 		 928 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  40.6 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.04 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  27.73 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.68 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  41.59 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.91 
 
 		 884 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  29.09 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 683 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.14 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  27.54 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  30.85 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  32.92 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.65 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.29 
 
 		 965 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 1122 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.63 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  30.39 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.69 
 
 		 269 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  32.84 
 
 		 1290 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 1332 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  35.07 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.17 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  28.38 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  40.79 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.56 
 
 		 1918 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  36.18 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.7 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.57 
 
 		 1441 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  27.97 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  31.52 
 
 		 1186 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>