263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1237 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
604 aa  1236    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  57.24 
 
 
471 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  49.75 
 
 
407 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  47.41 
 
 
408 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  50.26 
 
 
541 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  83.09 
 
 
1122 aa  352  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  45.65 
 
 
408 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  45.25 
 
 
399 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  48.06 
 
 
535 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  46.23 
 
 
693 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  46.25 
 
 
403 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  44.85 
 
 
567 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  43.24 
 
 
547 aa  316  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  44.42 
 
 
387 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  71.56 
 
 
1015 aa  312  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  43.51 
 
 
411 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  43.9 
 
 
548 aa  303  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  42.67 
 
 
597 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  69.46 
 
 
746 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  43.58 
 
 
558 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.93 
 
 
568 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  66.99 
 
 
780 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  67.16 
 
 
536 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 
541 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  71 
 
 
1164 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  63.16 
 
 
629 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  38.79 
 
 
727 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  38.18 
 
 
413 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  60 
 
 
490 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  39.28 
 
 
850 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  55.56 
 
 
965 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  59.07 
 
 
951 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.3 
 
 
574 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  53.95 
 
 
928 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  53.43 
 
 
501 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  38.74 
 
 
434 aa  208  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  54.31 
 
 
524 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  52.59 
 
 
509 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 
636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 
535 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  32.18 
 
 
532 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.96 
 
 
583 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.54 
 
 
535 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  30.22 
 
 
658 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  31.73 
 
 
640 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.52 
 
 
631 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  40.43 
 
 
320 aa  190  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  52.97 
 
 
533 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  31.23 
 
 
535 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.3 
 
 
589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.81 
 
 
441 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.3 
 
 
677 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  28.57 
 
 
533 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.48 
 
 
737 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  46.89 
 
 
837 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.68 
 
 
469 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.67 
 
 
445 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.81 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 
683 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  26.62 
 
 
433 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  45 
 
 
679 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  54.89 
 
 
912 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.48 
 
 
630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  26.26 
 
 
446 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.54 
 
 
587 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.81 
 
 
453 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25 
 
 
435 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.57 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  49.65 
 
 
618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  25.75 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  47.48 
 
 
464 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25.05 
 
 
440 aa  125  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  25.73 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  43.48 
 
 
1290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  22.58 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  27.91 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  49.26 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  23.77 
 
 
445 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 
470 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 
566 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  43.51 
 
 
479 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  45.8 
 
 
479 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.97 
 
 
945 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.04 
 
 
953 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  40.16 
 
 
1186 aa  84  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 
464 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.47 
 
 
988 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.77 
 
 
630 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  38.58 
 
 
1444 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  34.51 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  42.86 
 
 
383 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  36.67 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.6 
 
 
389 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  35.17 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30.38 
 
 
801 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.77 
 
 
982 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 
541 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  33.58 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 
639 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 
1132 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>