168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1068 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 797 aa  1620    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  37.9 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  35.39 
 
 		 1474 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  23.85 
 
 		 746 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.92 
 
 		 519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.46 
 
 		 546 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 516 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.53 
 
 		 539 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.96 
 
 		 532 aa  121  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 550 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 497 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.77 
 
 		 536 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 512 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.93 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.86 
 
 		 512 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.96 
 
 		 540 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.36 
 
 		 541 aa  112  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.34 
 
 		 541 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 		 537 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.39 
 
 		 537 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  31.44 
 
 		 517 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.83 
 
 		 566 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.72 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.87 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.47 
 
 		 577 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.3 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.81 
 
 		 559 aa  106  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 		 496 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 504 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 547 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.24 
 
 		 539 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.99 
 
 		 556 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 530 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 532 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  24.18 
 
 		 545 aa  96.3  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 536 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  24.59 
 
 		 552 aa  94.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 636 aa  94.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 524 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 		 537 aa  94  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  28.61 
 
 		 484 aa  94  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.41 
 
 		 562 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 572 aa  92  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.18 
 
 		 515 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 563 aa  91.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.42 
 
 		 522 aa  91.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  24.73 
 
 		 518 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.5 
 
 		 1585 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.98 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 581 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.27 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.93 
 
 		 546 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 1195 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.35 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 511 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  36.51 
 
 		 679 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 		 525 aa  77  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.53 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 522 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  26.09 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  45.74 
 
 		 516 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 665 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.38 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.44 
 
 		 1338 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 357 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  43.88 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 		 1015 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.2 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  30.5 
 
 		 1122 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  24.94 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  26.21 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  43.68 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  42.35 
 
 		 908 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  30.71 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  29.58 
 
 		 629 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1162 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  31.61 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30.37 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.65 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  27.86 
 
 		 1164 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  37.08 
 
 		 997 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>