46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0831 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 908 aa  1830    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  29.37 
 
 		 615 aa  104  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  28.92 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  44.9 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1270 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  42.05 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  38.95 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  36.28 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  41.18 
 
 		 990 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  44.16 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  42.35 
 
 		 797 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 520 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  44.05 
 
 		 763 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  43.75 
 
 		 844 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  40.79 
 
 		 931 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39.78 
 
 		 479 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  39.71 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  38.46 
 
 		 595 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  40 
 
 		 525 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  38.96 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  41.18 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 966 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.07 
 
 		 492 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  30.61 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  36.26 
 
 		 851 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 		 1092 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  35.06 
 
 		 679 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.9 
 
 		 673 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  37.5 
 
 		 896 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  27.34 
 
 		 668 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  39.13 
 
 		 685 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  39.13 
 
 		 689 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  35.42 
 
 		 468 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  39.02 
 
 		 430 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  30.23 
 
 		 545 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  32.65 
 
 		 997 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  33.75 
 
 		 1302 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1449 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.89 
 
 		 489 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  36.26 
 
 		 578 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 		 305 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  33 
 
 		 676 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1051 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.58 
 
 		 748 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  31.71 
 
 		 870 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>