83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1480 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  100 
 
 		 492 aa  1013    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2827  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  47.9 
 
 		 650 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000305574  hitchhiker  0.00171331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0683  sigma-70 factor  42 
 
 		 397 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481968  hitchhiker  0.000000266294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.5 
 
 		 612 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.5 
 
 		 606 aa  186  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1318  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.07 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0917  glycosy hydrolase family protein  34.34 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04100  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.61 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3886  glycosy hydrolase family protein  34.34 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.371175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0972  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.34 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2961  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.97 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00892323  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6329  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.06 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6029  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.06 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0780998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1279  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.76 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000518384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2256  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.53 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.020335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.95 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3290  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.85 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4875  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.85 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2047  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.08 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074716  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1159  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.86 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.91 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1066  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.5 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.980933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0385  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.52 
 
 		 732 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.677811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.91 
 
 		 507 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1003  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.99 
 
 		 897 aa  143  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.629221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.12 
 
 		 916 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.89 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.34 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03980  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.31 
 
 		 566 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6169  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.07 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04110  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.15 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6460  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.25 
 
 		 347 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  29.19 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  29.55 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4081  glycosyl hydrolase 53 protein  42.5 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05727  Endo-beta-1,4-galactanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS6]  28.93 
 
 		 369 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0903691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3080  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.55 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2125  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.62 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.825854 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1334  glycosyl hydrolase 53 protein  29.13 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03928  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.25 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 990 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  41.94 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  38.3 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.37 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  45.31 
 
 		 844 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  39.77 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  39.02 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  25 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  34.07 
 
 		 908 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  36.47 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  38.71 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  28.04 
 
 		 685 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  33.33 
 
 		 931 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  38.14 
 
 		 896 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38.54 
 
 		 615 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  37.25 
 
 		 287 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1162 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  36.08 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  38.89 
 
 		 997 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  46.03 
 
 		 562 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  32.86 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  30.48 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  38.46 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  34.02 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  33.73 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0883  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  35.94 
 
 		 851 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  40.85 
 
 		 763 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1270 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  32.46 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 966 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  29.79 
 
 		 748 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  31.17 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  30.28 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  30.21 
 
 		 668 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  29.9 
 
 		 545 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  27.71 
 
 		 750 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  30.63 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  37.23 
 
 		 538 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1215 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  33.33 
 
 		 333 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>