19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0155 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1087    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  43.18 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  36.71 
 
 		 469 aa  312  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  35.12 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  38.35 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  31.14 
 
 		 675 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.94 
 
 		 913 aa  203  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.8 
 
 		 911 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 835 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  35.92 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  28.32 
 
 		 636 aa  57  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  36.73 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 		 990 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  24.46 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  34 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  23.12 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  37.89 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  31.78 
 
 		 583 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.23 
 
 		 492 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>