41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5267 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  100 
 
 		 426 aa  864    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  25.2 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.8 
 
 		 966 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  32.29 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  36 
 
 		 2344 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  34.81 
 
 		 2169 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  34.75 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  35.37 
 
 		 1302 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.04 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  28.18 
 
 		 679 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  31.52 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  35 
 
 		 695 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  31.71 
 
 		 520 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.06 
 
 		 978 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.33 
 
 		 859 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.17 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  36.14 
 
 		 516 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  32.03 
 
 		 679 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1916 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  31.25 
 
 		 669 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  33.64 
 
 		 644 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.63 
 
 		 1094 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  27.91 
 
 		 2000 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.3 
 
 		 1120 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.14 
 
 		 748 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  26.03 
 
 		 2588 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.77 
 
 		 2122 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  34.62 
 
 		 1311 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  32.95 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.67 
 
 		 713 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  35.71 
 
 		 578 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  30 
 
 		 791 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  26.8 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  36.19 
 
 		 2833 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  37.14 
 
 		 685 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  27.85 
 
 		 997 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  37.25 
 
 		 967 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  33.33 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  30.12 
 
 		 1061 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.53 
 
 		 769 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>