34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1975 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  77.91 
 
 
875 aa  1393    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  100 
 
 
967 aa  1962    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  79.69 
 
 
2031 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  42.94 
 
 
929 aa  82  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  44.25 
 
 
503 aa  80.1  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  49.35 
 
 
2392 aa  79  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  34.57 
 
 
1732 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  58.82 
 
 
834 aa  75.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  62.75 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  56.9 
 
 
1502 aa  71.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  58.82 
 
 
1143 aa  70.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.99 
 
 
556 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  37.98 
 
 
2207 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  43 
 
 
795 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  47.5 
 
 
565 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.77 
 
 
501 aa  53.5  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  36.9 
 
 
576 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  42.35 
 
 
629 aa  52  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  34.71 
 
 
884 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  40.43 
 
 
887 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  34.12 
 
 
1126 aa  50.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 
727 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  45.83 
 
 
891 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  41.84 
 
 
886 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  33.88 
 
 
530 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  40 
 
 
699 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  37.5 
 
 
890 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  32 
 
 
893 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  39.32 
 
 
729 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  39.32 
 
 
729 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  36.79 
 
 
891 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.61 
 
 
948 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93602  predicted protein  34.12 
 
 
2146 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00915503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2716  hypothetical protein  36.99 
 
 
210 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>