52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2604 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1302 aa  2620    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  30.05 
 
 		 1206 aa  231  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.75 
 
 		 1236 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  25.44 
 
 		 898 aa  97.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.31 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  44.3 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  22.37 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  21.29 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  40 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  41.25 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  43.59 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  20.21 
 
 		 752 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  37.97 
 
 		 695 aa  56.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  43.42 
 
 		 540 aa  56.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1270 aa  55.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  35.44 
 
 		 287 aa  55.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  43.28 
 
 		 258 aa  55.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.37 
 
 		 966 aa  55.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  36.59 
 
 		 152 aa  55.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  39.39 
 
 		 2324 aa  53.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  31.73 
 
 		 1063 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  35.37 
 
 		 426 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40 
 
 		 741 aa  52.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  41.43 
 
 		 554 aa  52  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  19.49 
 
 		 688 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1117 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1117 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  34.65 
 
 		 578 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 547 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  36.96 
 
 		 748 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  35.53 
 
 		 687 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  28.92 
 
 		 997 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1010 aa  48.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  33.75 
 
 		 908 aa  48.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  37.66 
 
 		 495 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  37.63 
 
 		 496 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  39.44 
 
 		 516 aa  48.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  35.53 
 
 		 990 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  28.98 
 
 		 791 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 902 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  33.33 
 
 		 468 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  29.13 
 
 		 451 aa  46.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  22.61 
 
 		 709 aa  46.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  31.71 
 
 		 545 aa  46.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  38.46 
 
 		 586 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.19 
 
 		 608 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  33.98 
 
 		 475 aa  45.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  33 
 
 		 797 aa  45.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  27.01 
 
 		 778 aa  45.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  27.01 
 
 		 778 aa  45.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1046 aa  45.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>