16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5049 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  93.79 
 
 		 692 aa  1206    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1335    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  58.74 
 
 		 688 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  32.23 
 
 		 752 aa  257  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  24.73 
 
 		 721 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  30.1 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  21.68 
 
 		 1302 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  21.78 
 
 		 898 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  20.47 
 
 		 951 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.68 
 
 		 644 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  20.31 
 
 		 965 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.11 
 
 		 677 aa  50.8  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.99 
 
 		 789 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  20.97 
 
 		 838 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1121 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1282  hypothetical protein  27.32 
 
 		 481 aa  45.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>