37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1130 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 789 aa  1644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1121 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  27.33 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  24.06 
 
 		 752 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  24.07 
 
 		 832 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  23.42 
 
 		 838 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  23.34 
 
 		 951 aa  88.2  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  26.52 
 
 		 689 aa  87.8  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  24.69 
 
 		 839 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  22.03 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  23.94 
 
 		 1011 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  23.24 
 
 		 801 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  23.85 
 
 		 580 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  23.31 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  23.97 
 
 		 721 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  21.32 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  25.35 
 
 		 1049 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  22.09 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.4 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  24.52 
 
 		 2286 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  20.88 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  22.76 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.27 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  22.92 
 
 		 1206 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  24.91 
 
 		 898 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  24.16 
 
 		 1236 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  23.9 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1024 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  26.53 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.24 
 
 		 512 aa  47.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  27.66 
 
 		 514 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  23.81 
 
 		 688 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  39.02 
 
 		 576 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.59 
 
 		 410 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  31.03 
 
 		 474 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1022 aa  44.3  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  32.38 
 
 		 476 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>