19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2340 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 898 aa  1810    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.44 
 
 		 1206 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  23.97 
 
 		 1236 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  25.44 
 
 		 1302 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.36 
 
 		 644 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.91 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1024 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  25.13 
 
 		 709 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  20.78 
 
 		 679 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  22.17 
 
 		 752 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.01 
 
 		 708 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  21.9 
 
 		 692 aa  52  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  20.13 
 
 		 688 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  22.99 
 
 		 689 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  28.12 
 
 		 788 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  32.14 
 
 		 451 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  21.95 
 
 		 965 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3406  hypothetical protein  28.79 
 
 		 535 aa  44.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>