26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6426 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1434    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  75.46 
 
 		 709 aa  1088    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.69 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  25.32 
 
 		 752 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  24.66 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  22.24 
 
 		 677 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  24.14 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  23.12 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  24.05 
 
 		 689 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  22.56 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  25.48 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1121 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  24.92 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  23.54 
 
 		 1236 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  22.52 
 
 		 965 aa  64.3  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  21.92 
 
 		 839 aa  63.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  22.29 
 
 		 832 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  22.98 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  22.01 
 
 		 1206 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  22.96 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  22.77 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.27 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  23.4 
 
 		 801 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  25.3 
 
 		 898 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  22.34 
 
 		 1011 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  22.09 
 
 		 721 aa  47.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>