27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4027 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 644 aa  1273    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  51.18 
 
 		 709 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  51.69 
 
 		 708 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1121 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  25.53 
 
 		 648 aa  97.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.26 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  24.52 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  23.83 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  24.3 
 
 		 689 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  25.36 
 
 		 788 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.6 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  22.96 
 
 		 965 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  24.8 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  23.36 
 
 		 898 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  23.22 
 
 		 1206 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  21.84 
 
 		 627 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  22.9 
 
 		 801 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  26.1 
 
 		 791 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  22.79 
 
 		 838 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  20.65 
 
 		 832 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  25.59 
 
 		 752 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  22.73 
 
 		 839 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  24.8 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  25.88 
 
 		 679 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  25.88 
 
 		 692 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  23.26 
 
 		 688 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1748  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 454 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>