17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4588 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1358    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  57.18 
 
 		 688 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  93.79 
 
 		 679 aa  1238    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  32.72 
 
 		 752 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  24.43 
 
 		 721 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  34.07 
 
 		 689 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  21.29 
 
 		 1302 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  21.67 
 
 		 898 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  31.25 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.15 
 
 		 644 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  22.18 
 
 		 677 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.69 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1121 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1282  hypothetical protein  27.16 
 
 		 481 aa  45.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  19.61 
 
 		 951 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.88 
 
 		 838 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  24.4 
 
 		 708 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>