240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2195 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  67.12 
 
 		 951 aa  1335    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 965 aa  1989    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.18 
 
 		 2286 aa  386  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  73.57 
 
 		 928 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  68.45 
 
 		 501 aa  301  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  50.19 
 
 		 1015 aa  245  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  54.93 
 
 		 1122 aa  245  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  59.9 
 
 		 490 aa  240  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  57.64 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  55.71 
 
 		 746 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 		 604 aa  235  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  58.96 
 
 		 533 aa  235  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  51.9 
 
 		 524 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  50.6 
 
 		 1164 aa  228  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  54.59 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  55.17 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  51.72 
 
 		 509 aa  215  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  51.9 
 
 		 629 aa  204  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  27.32 
 
 		 839 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  52 
 
 		 679 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  47.71 
 
 		 837 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  49.76 
 
 		 683 aa  191  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  26.57 
 
 		 801 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  51.6 
 
 		 535 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.59 
 
 		 838 aa  182  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  26.89 
 
 		 627 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  25.08 
 
 		 832 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  26 
 
 		 722 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  37.25 
 
 		 1049 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.99 
 
 		 630 aa  154  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  26.5 
 
 		 648 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  50.75 
 
 		 464 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  50.78 
 
 		 912 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  48.67 
 
 		 618 aa  145  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  25 
 
 		 1011 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  26.21 
 
 		 580 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  47.76 
 
 		 469 aa  124  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  45.04 
 
 		 1290 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  43.94 
 
 		 479 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  42.97 
 
 		 470 aa  107  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  43.18 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  42.96 
 
 		 566 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  24.5 
 
 		 791 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  31.45 
 
 		 948 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.11 
 
 		 1186 aa  94.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  36.15 
 
 		 630 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.65 
 
 		 982 aa  86.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  54.67 
 
 		 383 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  56.45 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.22 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.64 
 
 		 945 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  38.28 
 
 		 536 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  37.04 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  34.85 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  47.62 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  33.85 
 
 		 401 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  60.29 
 
 		 961 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1121 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  23.1 
 
 		 788 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.38 
 
 		 1444 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.32 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.26 
 
 		 863 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  44.44 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  34.64 
 
 		 877 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  56.92 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.41 
 
 		 988 aa  72  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.4 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  36.64 
 
 		 639 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  46.67 
 
 		 567 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  36.63 
 
 		 450 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 953 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  51.61 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.07 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  53.23 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.32 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.68 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  21.8 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  54.84 
 
 		 741 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50.79 
 
 		 873 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 590 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.12 
 
 		 528 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.03 
 
 		 707 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  53.97 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.1 
 
 		 957 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  36.51 
 
 		 673 aa  66.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  56.45 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.34 
 
 		 1505 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.84 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  46.03 
 
 		 1077 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  51.61 
 
 		 591 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  44.74 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  49.15 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>