26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2913 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  100 
 
 		 752 aa  1536    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  28.38 
 
 		 721 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  32.23 
 
 		 679 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  32.72 
 
 		 688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  31.43 
 
 		 689 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1121 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  25 
 
 		 709 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.06 
 
 		 789 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  25.32 
 
 		 708 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.56 
 
 		 677 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  22.85 
 
 		 838 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  21.8 
 
 		 965 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  23.82 
 
 		 722 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  20.27 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  20.21 
 
 		 1302 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  28.97 
 
 		 627 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  22.03 
 
 		 898 aa  54.3  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.59 
 
 		 644 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  19.09 
 
 		 832 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  24.09 
 
 		 1011 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  23.17 
 
 		 1049 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  26.51 
 
 		 839 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  26.48 
 
 		 563 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  24.37 
 
 		 1206 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  25 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  23 
 
 		 1024 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>