12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4108 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 721 aa  1495    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  28.53 
 
 		 752 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  24.96 
 
 		 688 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  23.87 
 
 		 679 aa  156  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  24.55 
 
 		 689 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  23.75 
 
 		 692 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.68 
 
 		 789 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1121 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  32.08 
 
 		 410 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.79 
 
 		 677 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  22.41 
 
 		 708 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  20.38 
 
 		 965 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>