31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2973 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  95.43 
 
 
588 aa  1043    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  100 
 
 
586 aa  1167    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  48.57 
 
 
687 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  48.66 
 
 
687 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  49.91 
 
 
1117 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  49.55 
 
 
1117 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.92 
 
 
1206 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.35 
 
 
1236 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  37.93 
 
 
502 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  35.63 
 
 
943 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.28 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.76 
 
 
816 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.5 
 
 
456 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  36.84 
 
 
508 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.75 
 
 
2066 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  29.14 
 
 
1057 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  34.48 
 
 
3066 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  35.38 
 
 
1150 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  38.46 
 
 
1302 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.21 
 
 
1565 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  45 
 
 
734 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 
547 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.89 
 
 
1755 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.28 
 
 
910 aa  44.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.58 
 
 
463 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.48 
 
 
1526 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  25.83 
 
 
786 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  32.71 
 
 
451 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.644592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  29.1 
 
 
1143 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  36.79 
 
 
519 aa  44.3  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  28.12 
 
 
446 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>