37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2575 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 495 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  84.48 
 
 		 496 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  65.86 
 
 		 496 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  64.92 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  58.49 
 
 		 537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  55.81 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  44.78 
 
 		 547 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  38.32 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0302  polysaccharidase protein  32.7 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  30.86 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  44.44 
 
 		 1236 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  27.24 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0273  putative polysaccharidase protein  29.27 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.663657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.03 
 
 		 1206 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  38.36 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4392  Alpha-galactosidase  29.92 
 
 		 589 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941976  normal  0.0174119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  40.79 
 
 		 540 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.67 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  28.11 
 
 		 694 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  43.37 
 
 		 236 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  43.37 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  25.74 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  40.78 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  40.96 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  37.66 
 
 		 1302 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  34.59 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 		 759 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 		 677 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 2337 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  25.33 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3406  hypothetical protein  27.89 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  26.98 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.71 
 
 		 456 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  28 
 
 		 867 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1066 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  35.21 
 
 		 898 aa  43.5  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>