42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2979 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  79.11 
 
 		 537 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 		 541 aa  1080    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  62.08 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  59.93 
 
 		 497 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  55.43 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  56.16 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0302  polysaccharidase protein  30.49 
 
 		 381 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  41.04 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0273  putative polysaccharidase protein  29.69 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.663657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  38.02 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  25.54 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 		 565 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.98 
 
 		 1236 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  42.16 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.26 
 
 		 1206 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  40.52 
 
 		 232 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  39.32 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  44.71 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  45.88 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  42.35 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  38.89 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  25.9 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  43.53 
 
 		 513 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  26.67 
 
 		 540 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.9 
 
 		 759 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4392  Alpha-galactosidase  27.46 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941976  normal  0.0174119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  34.09 
 
 		 1706 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 		 677 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.85 
 
 		 7149 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  35.16 
 
 		 6715 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.23 
 
 		 5098 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  33.67 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.55 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  25.86 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  24.11 
 
 		 1110 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3406  hypothetical protein  30.07 
 
 		 535 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  41.25 
 
 		 3714 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 		 3508 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  31.58 
 
 		 8064 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  31.58 
 
 		 6310 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>