50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4845 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 456 aa  925    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  66.58 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.17 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  38.97 
 
 		 677 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 759 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1066 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.04 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.5 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.4 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  24.77 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  28.73 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  34.81 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  34.29 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.37 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.74 
 
 		 2031 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  26.4 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  48.28 
 
 		 1755 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5474  hypothetical protein  26.16 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  27.94 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.89 
 
 		 1236 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  27.13 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  25.5 
 
 		 341 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1117 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  29.32 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 588 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  33.81 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1117 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1463  hypothetical protein  26 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.57 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  28.05 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  38.57 
 
 		 1332 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  22.63 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  28.8 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.55 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.01 
 
 		 2286 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1024 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  24.71 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  33.33 
 
 		 653 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  26.07 
 
 		 871 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.44 
 
 		 1206 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  39.34 
 
 		 1092 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.93 
 
 		 1412 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  43.48 
 
 		 1771 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  37.04 
 
 		 153 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  37.25 
 
 		 965 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30.95 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  34.72 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.87 
 
 		 537 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 		 3066 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>