37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0628 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1382    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  32.67 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  28.83 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 1548 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  41.88 
 
 		 1465 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6943  hypothetical protein  24.76 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000267978  normal  0.67649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.19 
 
 		 1212 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  38.78 
 
 		 778 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1176 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.55 
 
 		 1357 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  36.71 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  33 
 
 		 794 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  34.13 
 
 		 986 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  34.13 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  32.12 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.13 
 
 		 955 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.23 
 
 		 1236 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  38.53 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.34 
 
 		 964 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  34.75 
 
 		 1084 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  29.93 
 
 		 421 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 1302 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  28.11 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.52 
 
 		 961 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  23 
 
 		 500 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.46 
 
 		 1206 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.43 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 		 547 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  31.43 
 
 		 646 aa  47.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  22.56 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.06 
 
 		 677 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  26.56 
 
 		 264 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>