17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1046    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  33.19 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  29.31 
 
 		 694 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6943  hypothetical protein  27.16 
 
 		 602 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000267978  normal  0.67649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  25.78 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  27.78 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.42 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.77 
 
 		 496 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.9 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.3 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  28.79 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  26.1 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 		 565 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.51 
 
 		 1206 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  36 
 
 		 1236 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.28 
 
 		 537 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  28.3 
 
 		 677 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>