71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3228 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  89.52 
 
 		 236 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  81.74 
 
 		 235 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  79.74 
 
 		 237 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  57.46 
 
 		 510 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  53.48 
 
 		 513 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  54.95 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  43.1 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  43.1 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  32 
 
 		 16322 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31.16 
 
 		 3508 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  41.35 
 
 		 276 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  30.26 
 
 		 4748 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.11 
 
 		 5745 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  44.44 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  40.52 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.86 
 
 		 1599 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  32.45 
 
 		 2251 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.76 
 
 		 2555 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.42 
 
 		 2768 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 		 4978 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.16 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  32.26 
 
 		 3714 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  30.85 
 
 		 2887 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  44.32 
 
 		 537 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.73 
 
 		 4122 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.29 
 
 		 3816 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  32.82 
 
 		 3182 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.63 
 
 		 1883 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.75 
 
 		 2067 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.8 
 
 		 1215 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.38 
 
 		 496 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  31.11 
 
 		 2524 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.8 
 
 		 1215 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  34.13 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.9 
 
 		 5098 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  32.76 
 
 		 5094 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 		 6779 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 		 6662 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 		 6683 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.25 
 
 		 1215 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  42.17 
 
 		 495 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.88 
 
 		 5020 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3758 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  47.46 
 
 		 4854 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 3552 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 		 3229 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 1215 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 1215 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  26 
 
 		 3259 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 2784 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.39 
 
 		 4836 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.55 
 
 		 1268 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.32 
 
 		 16311 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.81 
 
 		 3191 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.89 
 
 		 2816 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.38 
 
 		 3038 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  31.65 
 
 		 1586 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25.11 
 
 		 1269 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.42 
 
 		 1706 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  27.74 
 
 		 1269 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  30.92 
 
 		 3091 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  25.5 
 
 		 2060 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.4 
 
 		 9867 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  32.26 
 
 		 7149 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3739 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1806 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.57 
 
 		 3824 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3824 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.57 
 
 		 3824 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.57 
 
 		 3721 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>