32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2314 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  100 
 
 
261 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  55.81 
 
 
513 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  56.59 
 
 
510 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  56.3 
 
 
235 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  55.86 
 
 
236 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  54.62 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  54.95 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  38.97 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  35.82 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  33.72 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.16 
 
 
541 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.16 
 
 
537 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.19 
 
 
3038 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  46.91 
 
 
496 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  36.19 
 
 
3229 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 
7149 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.41 
 
 
497 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.04 
 
 
5098 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  32.76 
 
 
3182 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  36.46 
 
 
3758 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  28.95 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.91 
 
 
2067 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 
1599 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  33.82 
 
 
2887 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  31.31 
 
 
3259 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.59 
 
 
1553 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.1 
 
 
16311 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  32.81 
 
 
3508 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  38.33 
 
 
1586 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  38.33 
 
 
6678 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  32.69 
 
 
3714 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  34.72 
 
 
2524 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>