More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4139 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.24 
 
 		 3191 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  33.1 
 
 		 5745 aa  782    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.38 
 
 		 4836 aa  1319    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.7 
 
 		 2812 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.24 
 
 		 4220 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 4122 aa  7884    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  63.59 
 
 		 5442 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  63.95 
 
 		 4791 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.91 
 
 		 5787 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  64.93 
 
 		 16322 aa  1052    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 		 4978 aa  594  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  61.07 
 
 		 5444 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  60.72 
 
 		 6683 aa  567  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  60.72 
 
 		 6779 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  60.15 
 
 		 6662 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  62.21 
 
 		 4285 aa  560  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  61.96 
 
 		 2768 aa  541  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  46.35 
 
 		 7149 aa  484  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  33.92 
 
 		 4214 aa  479  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30.66 
 
 		 4848 aa  414  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.97 
 
 		 2239 aa  411  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.89 
 
 		 5839 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.32 
 
 		 3927 aa  385  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.51 
 
 		 5962 aa  368  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.94 
 
 		 5218 aa  362  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.86 
 
 		 6753 aa  356  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.01 
 
 		 9030 aa  354  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  40.77 
 
 		 4678 aa  353  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  41.32 
 
 		 8682 aa  352  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 		 1599 aa  351  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  33.14 
 
 		 1269 aa  336  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  32.98 
 
 		 1269 aa  332  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.23 
 
 		 9867 aa  330  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  32.82 
 
 		 1268 aa  318  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  31.44 
 
 		 3182 aa  258  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.4 
 
 		 1597 aa  238  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  48.29 
 
 		 2251 aa  209  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 2555 aa  205  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.83 
 
 		 1884 aa  192  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  34.19 
 
 		 1706 aa  187  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.91 
 
 		 8321 aa  184  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.28 
 
 		 3363 aa  176  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.5 
 
 		 3474 aa  167  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  42.5 
 
 		 3259 aa  161  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.97 
 
 		 2816 aa  154  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.95 
 
 		 2542 aa  151  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.19 
 
 		 4854 aa  150  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.91 
 
 		 2767 aa  147  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.19 
 
 		 1367 aa  139  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.33 
 
 		 2839 aa  139  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  25.79 
 
 		 2524 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 		 994 aa  130  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  34.57 
 
 		 814 aa  129  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  27.04 
 
 		 1363 aa  129  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 		 1428 aa  126  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.91 
 
 		 2074 aa  124  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.35 
 
 		 2807 aa  123  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 		 3816 aa  122  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.39 
 
 		 721 aa  120  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 850 aa  120  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.93 
 
 		 3477 aa  117  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.13 
 
 		 2887 aa  117  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 		 5171 aa  117  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 		 2027 aa  116  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 		 1867 aa  113  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.35 
 
 		 3714 aa  113  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  24 
 
 		 5020 aa  108  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  27.54 
 
 		 892 aa  106  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 2114 aa  106  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.29 
 
 		 2377 aa  104  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.15 
 
 		 761 aa  102  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  35.93 
 
 		 686 aa  98.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.74 
 
 		 1553 aa  97.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  25.57 
 
 		 7919 aa  95.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  26.35 
 
 		 3508 aa  95.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  24.24 
 
 		 2890 aa  94.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  24.85 
 
 		 6211 aa  92.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1699 aa  87.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.75 
 
 		 4465 aa  87  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.01 
 
 		 3758 aa  85.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.27 
 
 		 2353 aa  85.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  29.15 
 
 		 1166 aa  84.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  23.96 
 
 		 2011 aa  84.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1806 aa  84.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44.22 
 
 		 2452 aa  84.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.74 
 
 		 1066 aa  83.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  24.95 
 
 		 7679 aa  83.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.02 
 
 		 3544 aa  83.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.09 
 
 		 3038 aa  80.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  24.59 
 
 		 2084 aa  80.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 3184 aa  80.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 2067 aa  79.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  46.23 
 
 		 1712 aa  79  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  39.62 
 
 		 3229 aa  78.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  23.79 
 
 		 2040 aa  78.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.26 
 
 		 2704 aa  77.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  24.48 
 
 		 2039 aa  77.4  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  41.75 
 
 		 1006 aa  76.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  28.24 
 
 		 2334 aa  75.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>