More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1227 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  61.37 
 
 		 2768 aa  1405    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  100 
 
 		 2251 aa  4440    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.98 
 
 		 4220 aa  377  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  47.95 
 
 		 4791 aa  377  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.49 
 
 		 16322 aa  335  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  37.08 
 
 		 2127 aa  286  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.95 
 
 		 5787 aa  262  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  41.48 
 
 		 5442 aa  236  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  41.69 
 
 		 4214 aa  234  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.09 
 
 		 5839 aa  227  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  48.36 
 
 		 4285 aa  222  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.13 
 
 		 6779 aa  220  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.6 
 
 		 4836 aa  220  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.13 
 
 		 6683 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.86 
 
 		 6662 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.39 
 
 		 2812 aa  214  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.75 
 
 		 4122 aa  214  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  40.16 
 
 		 7149 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  34.99 
 
 		 2042 aa  203  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.27 
 
 		 5098 aa  150  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.49 
 
 		 5171 aa  150  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.45 
 
 		 3396 aa  150  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.14 
 
 		 1867 aa  131  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.37 
 
 		 1599 aa  130  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  33.69 
 
 		 3182 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  32.75 
 
 		 2542 aa  115  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  50.33 
 
 		 6753 aa  110  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  47.52 
 
 		 5218 aa  109  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  27.67 
 
 		 2353 aa  105  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  45.75 
 
 		 8682 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45.75 
 
 		 9030 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.41 
 
 		 5899 aa  103  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  34.83 
 
 		 5444 aa  101  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.92 
 
 		 2239 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  56.67 
 
 		 4678 aa  99  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.87 
 
 		 5745 aa  99  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  43.08 
 
 		 2890 aa  98.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  32.78 
 
 		 2524 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.77 
 
 		 8321 aa  98.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.55 
 
 		 2452 aa  96.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  52 
 
 		 4848 aa  96.3  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.9 
 
 		 5020 aa  95.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  48.74 
 
 		 4106 aa  94.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 709 aa  94.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  40.49 
 
 		 2887 aa  94  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.09 
 
 		 2678 aa  94  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.82 
 
 		 1661 aa  92.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 		 260 aa  90.1  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  55 
 
 		 786 aa  89.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1699 aa  89  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  48.41 
 
 		 2704 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.87 
 
 		 5962 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1424 aa  88.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  40.98 
 
 		 373 aa  87.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.72 
 
 		 4978 aa  87.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 		 817 aa  87  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.88 
 
 		 202 aa  86.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 202 aa  86.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  41.01 
 
 		 4854 aa  86.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  52.27 
 
 		 3229 aa  85.9  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.41 
 
 		 2667 aa  85.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.41 
 
 		 2885 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.41 
 
 		 1236 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  48.6 
 
 		 1166 aa  85.5  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.91 
 
 		 1118 aa  85.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  31.48 
 
 		 2193 aa  84.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.58 
 
 		 1016 aa  84.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  24.9 
 
 		 2125 aa  84.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  60.98 
 
 		 813 aa  84  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  44.76 
 
 		 2145 aa  84  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  48.18 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  39.38 
 
 		 814 aa  83.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  28.68 
 
 		 1029 aa  83.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1113 aa  83.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.85 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  45.95 
 
 		 686 aa  83.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  53.26 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  59.52 
 
 		 1499 aa  82.4  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  54.64 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  50.45 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  37.24 
 
 		 3263 aa  81.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  48.76 
 
 		 757 aa  82.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.69 
 
 		 1631 aa  81.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.18 
 
 		 1029 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.26 
 
 		 1553 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.19 
 
 		 1712 aa  81.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.19 
 
 		 2775 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  56.96 
 
 		 1287 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  51.25 
 
 		 2329 aa  80.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 686 aa  80.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  44.79 
 
 		 9867 aa  80.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  38.92 
 
 		 411 aa  80.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.84 
 
 		 1222 aa  80.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  57.14 
 
 		 1156 aa  80.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  49.11 
 
 		 1164 aa  79.7  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 2336 aa  79.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.76 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 980 aa  79.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  53.57 
 
 		 3314 aa  79.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.66 
 
 		 3427 aa  79.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>