More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0276 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 3091 aa  6163    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.67 
 
 		 2784 aa  273  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.28 
 
 		 4285 aa  235  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  23.71 
 
 		 2567 aa  187  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.06 
 
 		 4661 aa  183  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.02 
 
 		 16311 aa  159  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.58 
 
 		 3182 aa  155  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.14 
 
 		 8871 aa  148  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.61 
 
 		 2067 aa  148  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 3259 aa  147  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  24.32 
 
 		 3229 aa  142  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28 
 
 		 3714 aa  139  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.04 
 
 		 1553 aa  132  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  48.46 
 
 		 1035 aa  131  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  23.88 
 
 		 4854 aa  128  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  25.53 
 
 		 3508 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.35 
 
 		 5020 aa  127  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.1 
 
 		 6678 aa  122  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  24.38 
 
 		 3439 aa  113  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  26.18 
 
 		 2127 aa  100  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  25.86 
 
 		 1883 aa  92  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  24.69 
 
 		 5094 aa  90.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1538 aa  90.1  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.27 
 
 		 2346 aa  89  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.15 
 
 		 5098 aa  89  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.66 
 
 		 2239 aa  88.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  57.65 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  25.63 
 
 		 3758 aa  85.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.07 
 
 		 2812 aa  85.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.74 
 
 		 202 aa  83.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 202 aa  83.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.36 
 
 		 2885 aa  82.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  41.21 
 
 		 504 aa  82.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 1712 aa  81.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  55.32 
 
 		 1279 aa  81.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.6 
 
 		 5962 aa  81.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  56.1 
 
 		 709 aa  81.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  40.54 
 
 		 1814 aa  81.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.42 
 
 		 1795 aa  82  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.96 
 
 		 2667 aa  81.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.66 
 
 		 1236 aa  81.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.65 
 
 		 2775 aa  81.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.17 
 
 		 3427 aa  80.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 2537 aa  80.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  54.84 
 
 		 2105 aa  80.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.14 
 
 		 5839 aa  80.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  45.38 
 
 		 940 aa  80.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.33 
 
 		 4106 aa  79.7  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.06 
 
 		 1963 aa  79.7  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  50 
 
 		 3619 aa  79  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.22 
 
 		 1166 aa  79  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  46.34 
 
 		 572 aa  79.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  31.49 
 
 		 2452 aa  78.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.39 
 
 		 5218 aa  78.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  48.35 
 
 		 744 aa  78.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  44.19 
 
 		 999 aa  78.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  56.82 
 
 		 1534 aa  77.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  54.88 
 
 		 1526 aa  77.8  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 		 260 aa  78.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  44.96 
 
 		 1480 aa  78.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  55.21 
 
 		 1855 aa  77.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.23 
 
 		 485 aa  77.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  60.87 
 
 		 855 aa  77.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  57.14 
 
 		 219 aa  77  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.12 
 
 		 4678 aa  76.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 		 795 aa  76.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  51.76 
 
 		 998 aa  76.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.72 
 
 		 14916 aa  76.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  46.15 
 
 		 2329 aa  76.3  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  51.58 
 
 		 1055 aa  76.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.61 
 
 		 1499 aa  75.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  47.83 
 
 		 769 aa  75.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  44.85 
 
 		 1383 aa  74.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.5 
 
 		 1164 aa  74.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.91 
 
 		 2678 aa  75.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  27.4 
 
 		 2336 aa  75.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  36.69 
 
 		 2245 aa  75.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  58.14 
 
 		 280 aa  74.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.76 
 
 		 980 aa  74.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.66 
 
 		 2182 aa  74.3  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.19 
 
 		 2668 aa  74.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  48.67 
 
 		 1141 aa  74.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  52.87 
 
 		 2296 aa  74.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 1016 aa  73.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  53.01 
 
 		 2107 aa  74.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  45.38 
 
 		 3619 aa  73.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  51.19 
 
 		 385 aa  73.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  58.33 
 
 		 1156 aa  73.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.41 
 
 		 5787 aa  73.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  27.58 
 
 		 2337 aa  73.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  44.03 
 
 		 867 aa  73.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.23 
 
 		 1421 aa  73.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 851 aa  73.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  48.48 
 
 		 1532 aa  73.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  51.95 
 
 		 161 aa  73.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.67 
 
 		 8682 aa  72.8  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.87 
 
 		 959 aa  72.8  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  44.44 
 
 		 7284 aa  72.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  42.75 
 
 		 782 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  49.32 
 
 		 3598 aa  72.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>