More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1122 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2784 aa  5548    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  28.25 
 
 		 4661 aa  619  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.26 
 
 		 4285 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  29.13 
 
 		 3229 aa  508  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  27.56 
 
 		 4854 aa  420  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 3439 aa  394  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.51 
 
 		 3259 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  27.81 
 
 		 2567 aa  384  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.46 
 
 		 2812 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.61 
 
 		 5020 aa  367  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.82 
 
 		 16311 aa  353  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 		 3091 aa  308  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  25.55 
 
 		 3182 aa  284  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.36 
 
 		 3714 aa  275  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 		 3508 aa  270  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  26.99 
 
 		 5094 aa  262  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.4 
 
 		 1553 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.95 
 
 		 2067 aa  255  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.46 
 
 		 8871 aa  254  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.05 
 
 		 1883 aa  253  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  28.42 
 
 		 2743 aa  234  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.71 
 
 		 6678 aa  231  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  26.63 
 
 		 3758 aa  210  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.12 
 
 		 2239 aa  181  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  29.56 
 
 		 2127 aa  180  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.42 
 
 		 14916 aa  164  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 		 1884 aa  150  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.4 
 
 		 1599 aa  149  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  25.25 
 
 		 3927 aa  147  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  29.1 
 
 		 1206 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.72 
 
 		 2887 aa  134  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  46.83 
 
 		 1035 aa  131  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.9 
 
 		 8321 aa  129  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 		 1141 aa  119  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 1963 aa  119  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 		 2555 aa  112  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  31.23 
 
 		 1728 aa  111  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  31.03 
 
 		 2461 aa  103  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  25.05 
 
 		 2524 aa  98.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  26.82 
 
 		 2337 aa  97.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1350 aa  97.1  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1806 aa  96.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  27.49 
 
 		 2060 aa  95.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.03 
 
 		 3026 aa  92.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1538 aa  90.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.22 
 
 		 5098 aa  90.9  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  44.25 
 
 		 1814 aa  87.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.48 
 
 		 3191 aa  86.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  42.61 
 
 		 2329 aa  85.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.29 
 
 		 4798 aa  82.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.97 
 
 		 2678 aa  82.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  23.16 
 
 		 4978 aa  82.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  47.73 
 
 		 2537 aa  82  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  42.28 
 
 		 940 aa  82.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.38 
 
 		 2105 aa  81.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  25.16 
 
 		 3132 aa  81.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 		 2452 aa  80.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  25.67 
 
 		 1867 aa  79.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.45 
 
 		 485 aa  79  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  30.15 
 
 		 1215 aa  79  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.54 
 
 		 1795 aa  79  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.85 
 
 		 2507 aa  79  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.13 
 
 		 260 aa  78.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.67 
 
 		 2346 aa  78.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.25 
 
 		 3427 aa  78.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.07 
 
 		 1215 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.07 
 
 		 1215 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  50 
 
 		 280 aa  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.3 
 
 		 202 aa  77  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  36.3 
 
 		 202 aa  77  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.26 
 
 		 1706 aa  76.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  48.19 
 
 		 1424 aa  76.3  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.12 
 
 		 3598 aa  76.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  43.09 
 
 		 2107 aa  76.3  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  48.89 
 
 		 280 aa  75.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 1215 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  41.84 
 
 		 236 aa  75.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  39.42 
 
 		 219 aa  75.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 534 aa  75.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 1215 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  24.39 
 
 		 5745 aa  75.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.98 
 
 		 1534 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 744 aa  75.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.57 
 
 		 460 aa  75.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  39.8 
 
 		 236 aa  74.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  48.86 
 
 		 1607 aa  74.3  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 572 aa  73.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  45.87 
 
 		 946 aa  73.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  43.96 
 
 		 686 aa  73.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 		 3954 aa  73.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.64 
 
 		 4334 aa  73.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.54 
 
 		 1019 aa  72.8  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.55 
 
 		 1164 aa  72.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 1532 aa  72  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.7 
 
 		 3038 aa  72.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  51.81 
 
 		 1855 aa  72  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  48.24 
 
 		 2667 aa  71.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.48 
 
 		 219 aa  72  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.6 
 
 		 867 aa  71.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  45.05 
 
 		 615 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>