More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1648 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  65.42 
 
 
2107 aa  869    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  62.92 
 
 
1814 aa  949    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  100 
 
 
940 aa  1889    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  61.61 
 
 
1607 aa  765    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  77.68 
 
 
1789 aa  1328    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  39.09 
 
 
1499 aa  352  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.4 
 
 
1480 aa  322  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.61 
 
 
999 aa  320  9e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.29 
 
 
3598 aa  294  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  32.06 
 
 
960 aa  287  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  32.14 
 
 
1112 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  71.9 
 
 
435 aa  174  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  37.41 
 
 
959 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  35.76 
 
 
541 aa  157  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.7 
 
 
1306 aa  156  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.42 
 
 
1925 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  34.26 
 
 
844 aa  146  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.07 
 
 
679 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.29 
 
 
4798 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  42.77 
 
 
1809 aa  131  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  44.89 
 
 
4687 aa  127  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  37.79 
 
 
860 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  40.45 
 
 
1156 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.18 
 
 
928 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  38.82 
 
 
618 aa  119  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  47.79 
 
 
585 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 
1383 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  36.57 
 
 
428 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50.98 
 
 
421 aa  115  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  42.34 
 
 
466 aa  114  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  39.49 
 
 
326 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  47.06 
 
 
582 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  35.17 
 
 
1217 aa  112  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
4334 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  45.24 
 
 
548 aa  107  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.2 
 
 
2954 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  36.23 
 
 
998 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.03 
 
 
813 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.78 
 
 
2105 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
1963 aa  106  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  40.12 
 
 
855 aa  105  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
260 aa  104  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.47 
 
 
1795 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 
219 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.31 
 
 
3427 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.11 
 
 
2667 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.53 
 
 
3619 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 
2885 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.44 
 
 
3619 aa  101  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.17 
 
 
1532 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.88 
 
 
1424 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.55 
 
 
1236 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
588 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.52 
 
 
677 aa  99.4  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.01 
 
 
219 aa  98.2  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.95 
 
 
1164 aa  97.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  42.76 
 
 
572 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.75 
 
 
485 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.13 
 
 
1538 aa  97.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.56 
 
 
686 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.11 
 
 
946 aa  96.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  43.52 
 
 
532 aa  95.9  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.61 
 
 
1016 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  37.37 
 
 
2689 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 
1534 aa  94.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  58.14 
 
 
265 aa  94.4  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.92 
 
 
2678 aa  94.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  40.96 
 
 
2682 aa  94  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.38 
 
 
795 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  39.22 
 
 
942 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.38 
 
 
3608 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.51 
 
 
833 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 
2296 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.48 
 
 
980 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.54 
 
 
757 aa  92  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.93 
 
 
5098 aa  91.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.9 
 
 
202 aa  91.3  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 
202 aa  91.3  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.37 
 
 
2346 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 
744 aa  91.3  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.87 
 
 
589 aa  91.3  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  53.77 
 
 
1421 aa  90.9  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  35.98 
 
 
788 aa  90.9  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  54.9 
 
 
3091 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.85 
 
 
982 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 
526 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.11 
 
 
1279 aa  89.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  37.13 
 
 
1526 aa  89.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  43.23 
 
 
938 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.94 
 
 
3209 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.42 
 
 
1544 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.2 
 
 
1594 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.61 
 
 
950 aa  88.6  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 
767 aa  88.6  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.08 
 
 
709 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  38.15 
 
 
2113 aa  87.8  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  42.59 
 
 
320 aa  87.8  8e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  47.11 
 
 
2537 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  45.38 
 
 
2329 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  42.38 
 
 
257 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>