More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02754 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  78.81 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.63 
 
 		 946 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.9 
 
 		 1963 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  35.83 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.51 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  51 
 
 		 2667 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.96 
 
 		 1795 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.73 
 
 		 2105 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 1022 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  49.14 
 
 		 1363 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.55 
 
 		 3427 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.74 
 
 		 280 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 1017 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.35 
 
 		 1279 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51 
 
 		 1236 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  47.57 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  51 
 
 		 2885 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 		 709 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.22 
 
 		 3619 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.22 
 
 		 3619 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  44.8 
 
 		 526 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  45.95 
 
 		 1814 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.22 
 
 		 980 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.32 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.44 
 
 		 2678 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.93 
 
 		 959 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.74 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  56 
 
 		 5839 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  41.03 
 
 		 4798 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40.96 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.93 
 
 		 2668 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  42.4 
 
 		 686 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  38.93 
 
 		 860 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  41.38 
 
 		 998 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.31 
 
 		 588 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 744 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.69 
 
 		 867 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  45.19 
 
 		 1421 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  44.92 
 
 		 615 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  41.84 
 
 		 2784 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 		 734 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.15 
 
 		 577 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  42.28 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.73 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.93 
 
 		 769 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  43.52 
 
 		 411 aa  75.1  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  42.97 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 724 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.63 
 
 		 1553 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.31 
 
 		 1164 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  37.4 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.28 
 
 		 1372 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  38.85 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 3954 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.44 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001277  calcium binding protein  36.65 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 4334 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1175 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.63 
 
 		 982 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 		 1287 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.61 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  37.31 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  48.11 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 		 1895 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  35 
 
 		 1306 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.67 
 
 		 3608 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40.98 
 
 		 2775 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1424 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.97 
 
 		 595 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  44.54 
 
 		 1499 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.79 
 
 		 2954 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  38.62 
 
 		 1043 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  36.49 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35 
 
 		 1156 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.28 
 
 		 2067 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.73 
 
 		 950 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.98 
 
 		 1712 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  50.57 
 
 		 3598 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  46.59 
 
 		 2452 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40 
 
 		 679 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1538 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.9 
 
 		 2145 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  41.18 
 
 		 942 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  47.87 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 		 1534 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.5 
 
 		 460 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.06 
 
 		 4106 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.59 
 
 		 5098 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  43.31 
 
 		 1400 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  40.34 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  42.2 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  30.17 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>