More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06445 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  93.49 
 
 		 959 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  100 
 
 		 860 aa  1648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  55.6 
 
 		 1112 aa  492  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.78 
 
 		 1156 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.64 
 
 		 1499 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  31.61 
 
 		 1217 aa  299  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  33.66 
 
 		 1814 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.49 
 
 		 4798 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.55 
 
 		 2954 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 2107 aa  230  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.41 
 
 		 855 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.58 
 
 		 1789 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.2 
 
 		 1421 aa  207  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.48 
 
 		 946 aa  207  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  27.87 
 
 		 1480 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.2 
 
 		 1279 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.57 
 
 		 4334 aa  205  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.97 
 
 		 1363 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  28.63 
 
 		 2245 aa  204  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.99 
 
 		 3598 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  30.98 
 
 		 1400 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.12 
 
 		 3209 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.48 
 
 		 1079 aa  187  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.28 
 
 		 1607 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 4800 aa  180  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.38 
 
 		 2911 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31 
 
 		 4687 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 1855 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.74 
 
 		 965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.37 
 
 		 1145 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  28.28 
 
 		 1383 aa  160  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 		 1884 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 		 3954 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.19 
 
 		 2689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 		 1795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  35.53 
 
 		 595 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 824 aa  148  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.82 
 
 		 1197 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 1534 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 589 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.83 
 
 		 1532 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.64 
 
 		 2667 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.62 
 
 		 2133 aa  134  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.31 
 
 		 1415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.12 
 
 		 2105 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.47 
 
 		 2775 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 980 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1306 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.96 
 
 		 928 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 1102 aa  128  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  31.69 
 
 		 2836 aa  127  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.67 
 
 		 1544 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.52 
 
 		 1164 aa  127  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  43.84 
 
 		 686 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  42.01 
 
 		 460 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.1 
 
 		 942 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  42.92 
 
 		 460 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.45 
 
 		 1895 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  29.31 
 
 		 613 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.01 
 
 		 2668 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.66 
 
 		 260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  32.52 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  28.06 
 
 		 999 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 795 aa  119  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.36 
 
 		 2807 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 		 1582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.51 
 
 		 1236 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.55 
 
 		 2678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  29.01 
 
 		 682 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  38.76 
 
 		 940 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  28.63 
 
 		 2097 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.22 
 
 		 3427 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 		 387 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.6 
 
 		 2885 aa  114  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.56 
 
 		 2467 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  30.94 
 
 		 932 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  34.9 
 
 		 437 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.94 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  34.11 
 
 		 960 aa  110  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  32.85 
 
 		 709 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.69 
 
 		 1884 aa  109  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.06 
 
 		 9867 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  32.52 
 
 		 437 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.21 
 
 		 421 aa  108  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.03 
 
 		 4723 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.98 
 
 		 1180 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.89 
 
 		 833 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.01 
 
 		 1286 aa  106  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  34.87 
 
 		 615 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.79 
 
 		 1016 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  33.42 
 
 		 396 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.12 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.7 
 
 		 3026 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 		 341 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  28 
 
 		 1134 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 		 341 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  55 
 
 		 280 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  29.52 
 
 		 928 aa  101  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1043 aa  101  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>