More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2715 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  100 
 
 		 3026 aa  5949    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2719  hemolysin-type calcium-binding protein  82.75 
 
 		 796 aa  1191    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  31.83 
 
 		 2467 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.32 
 
 		 1415 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.42 
 
 		 3954 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2717  hypothetical protein  46.95 
 
 		 498 aa  350  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00657711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.52 
 
 		 2807 aa  345  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.07 
 
 		 4334 aa  305  9e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.53 
 
 		 1855 aa  282  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  35.03 
 
 		 2133 aa  280  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  26.91 
 
 		 3209 aa  249  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  33.82 
 
 		 1134 aa  248  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  39.63 
 
 		 2198 aa  245  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.25 
 
 		 2954 aa  242  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.89 
 
 		 1400 aa  228  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  32.19 
 
 		 1133 aa  221  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.91 
 
 		 1534 aa  211  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 		 1764 aa  210  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.86 
 
 		 3619 aa  207  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.04 
 
 		 3608 aa  206  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.86 
 
 		 3619 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.66 
 
 		 1884 aa  201  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.45 
 
 		 2689 aa  201  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.18 
 
 		 2911 aa  196  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.83 
 
 		 1532 aa  193  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.5 
 
 		 1145 aa  184  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  27.81 
 
 		 1079 aa  182  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 907 aa  177  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 		 946 aa  176  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.81 
 
 		 824 aa  171  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  26.89 
 
 		 4800 aa  169  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  26.24 
 
 		 1156 aa  164  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.85 
 
 		 1499 aa  162  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  38.48 
 
 		 395 aa  159  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  27.18 
 
 		 2097 aa  158  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.19 
 
 		 395 aa  158  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.52 
 
 		 1279 aa  158  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.78 
 
 		 3598 aa  157  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.78 
 
 		 1029 aa  155  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  34.78 
 
 		 1029 aa  155  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.45 
 
 		 2950 aa  150  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.21 
 
 		 1363 aa  150  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 		 851 aa  149  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 		 1582 aa  148  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  28.34 
 
 		 1895 aa  147  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.93 
 
 		 1480 aa  148  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  42.04 
 
 		 768 aa  147  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  38.32 
 
 		 1728 aa  145  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.53 
 
 		 2836 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 2337 aa  140  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.41 
 
 		 1197 aa  139  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 820 aa  138  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  31.65 
 
 		 1883 aa  138  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 		 462 aa  137  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.72 
 
 		 2667 aa  135  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.12 
 
 		 595 aa  135  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  29.74 
 
 		 965 aa  133  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.63 
 
 		 2105 aa  133  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  36.25 
 
 		 1610 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.35 
 
 		 2678 aa  129  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.33 
 
 		 980 aa  129  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1424 aa  129  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.9 
 
 		 1795 aa  129  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  23.34 
 
 		 2245 aa  129  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 2107 aa  127  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.17 
 
 		 1019 aa  126  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 		 467 aa  126  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  27.6 
 
 		 1544 aa  125  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  45.31 
 
 		 727 aa  125  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.57 
 
 		 3427 aa  125  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.24 
 
 		 860 aa  125  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.47 
 
 		 1168 aa  124  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 		 503 aa  123  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  37.42 
 
 		 942 aa  122  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 		 503 aa  122  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  26.62 
 
 		 1286 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  28.68 
 
 		 1164 aa  120  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.99 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 		 9867 aa  120  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.62 
 
 		 745 aa  120  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 448 aa  119  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 		 475 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.87 
 
 		 2775 aa  117  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.55 
 
 		 556 aa  117  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  48.1 
 
 		 475 aa  117  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.79 
 
 		 855 aa  116  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 		 795 aa  115  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  27.77 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  35.74 
 
 		 574 aa  113  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.79 
 
 		 15831 aa  113  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.26 
 
 		 588 aa  113  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  32.22 
 
 		 5020 aa  113  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.68 
 
 		 1180 aa  113  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.99 
 
 		 1055 aa  113  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 		 526 aa  111  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  27.94 
 
 		 1814 aa  111  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 1112 aa  111  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.22 
 
 		 518 aa  111  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  38.36 
 
 		 2145 aa  111  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  35.79 
 
 		 3508 aa  110  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>